車間通風系統工程對設備（特別是通風柜）是有一定標準和要求的。拋開設備因素，單純從系統設計上考慮，通風空調系統的設計要考慮以下幾個主要因素：（1）保證實驗室的安全性，保證一定數量的換氣次數；（2）解決通風系統負壓的設計和系統控制；（3）在滿足換氣次數和全新風條件下，控制能耗。（4）系統穩定可靠。

通風采用全新風系統，通風柜的排氣不在室內循環。通風柜的風量平衡可以采用定風量控制系統，即排風量恒定，送風量和門窗縫隙補充風量恒定。此方法適用于zui大排風量滿足zui小換氣次數要求的生產車間。對于排風量遠大于zui小通風量要求的房間還可以采用兩段式通風控制系統保證風量平衡，即根據通風柜的位移信號，排風機、送風機有2種送風工況，低風量工況應用于維持zui小換氣次數的要求，節約能耗。同時自控系統改變全新風風機的頻率，降低風量，維持負壓平衡。變風量系統可以降低系統能耗。系統zui大、zui小換氣次數接近則考慮采用定風量系統，使得系統簡單，降低初投資。

通風系統除上文所述對通風柜有特殊要求外，對其他設備和控制系統也有一定的要求和標準。通風柜的選擇除滿足排風和捕捉能力外，還要注意需要根據調節門移動而立即改變風量，維持表面風速的恒定。怡帆機電建議系統風量的測定和控制以柜門位移為信號而不是測定表面風速來測定。生產車間壓力控制和zui小通風量的控制除了設備選型因素以外，排風通風工程設計和控制系統是關鍵因素，要保證系統的反應時間要足夠短（<1秒），通風系統不平衡會導致通風柜排風和捕捉能力散失，氣流流出車間，建筑物內壓力不穩定。