自清洗式紫外線消毒器機是肉眼看不見的光波。它存在于光譜紫色端的外側，因此稱為紫外光。紫外線來自太陽輻射的一種電磁波。紫外線通常根據波長分為四類。下面是物質運動的一種特殊形式，它是一種不相連的粒子流。每個波長為 253.7nm 的紫外光子具有 4.9eV 的能量。
當紫外線照射到微生物上時，發生能量轉移和積累，積累導致微生物失活，從而達到消毒的目的。當細菌和病毒吸收超過3600~65000uW/c㎡時，就會產生很強的脫氧核糖核酸（DNA）和核糖核酸（RNA），會使細菌和病毒失去生存能力和繁殖力。消滅細菌和病毒，達到消毒殺菌的效果。
一方面，紫外線會引起核酸突變，阻礙其復制、轉錄阻斷和蛋白質合成；另一方面，自由基的產生會引起光電離，導致細胞死亡。
紫外線殺菌器具有輻射強度穩定性高，殺菌壽命長達9000小時，高透光率石英玻璃管，透光率≥90%，輻射強度穩定在253.7um等優點。高亮度鏡面殺菌反應室設計。殺菌率可達99.99%。
自清洗式紫外線消毒器機的殺菌原理是利用紫外線燈管的輻射強度，即紫外線殺菌燈發出的輻射強度，與照射消毒劑的距離成反比。當照射強度一定時，被照射的消毒劑停留的時間越長，離殺菌燈越近，殺菌效果越好，反之亦然。
