有機肥料廢氣處理設備方案1：在系統正常運行后，處理系統排出的含有惡臭成分的氣體直接作為沼氣加熱鍋爐的供氣氣源，在焚燒的情況下，惡臭氣體的去除效率能夠達到99.9％。

有機肥料廢氣處理設備 方案2：在系統啟動和調試階段以及沼氣鍋爐出現事故時，系統收集的含惡臭成分的氣體可以通過惡臭氣體吸附塔處理，吸附塔可以采用酸、堿或次氯酸鈉鹽淋洗脫臭法，也可以采用活性碳吸附脫臭法。 對于系統內部一些釋放惡臭氣體的環節如糞便污泥人口處等惡臭氣體的控制可以采用加人進口除臭藥劑的辦法進行處理，根據北京高碑店糞便廢水處理廠的運行經驗，使用除臭藥劑除臭的運行成本很高，但處理效果卻受較大的限制，因此，在系統設計時使用除臭藥劑只能作為小范圍使用，主要氣體的除臭都必須使用上述的兩種方案之一。研究表明，糞渣污泥的處理和處置涉及污泥脫水、上清液生物處理以及糞渣堆肥等工藝過程，在綜合處理全過程的幾個主要階段即：脫水階段、厭氧消化階段、好氧消化階段和堆肥階段都會產生高濃度的惡臭氣體，為防止糞渣污泥處理處置過程中惡臭氣體對環境造成的污染，可以采用沼氣鍋爐焚燒和洗滌塔相結合的除臭工藝，為減少除臭成本，不推薦使用除臭藥劑的辦法，洗滌塔除臭也只有在系統啟動、調試和沼氣鍋爐發生故障的情況下使用。