沼氣生物脫硫，綠色硫細菌是一種嚴格厭氧的光能自養型微生物。在光照和無機營養物質存在的情況下，綠色硫細菌可以利用CO₂合成新的細胞物質，同時將S^2-轉化為單質硫并釋放在細胞外部，這些特點使綠色硫細菌非常適合生物脫硫過程，其脫硫反應過程如下：

　　值得注意的是，在一定條件下綠色硫細菌會將單質硫進一步氧化為SO₄^2-，反應過程如下：

　　因此，脫硫效果與光照強度之間存在的關系是光照不足影響脫硫效果，光照過剩導致SO₄^2-的生成，只有在光照適宜的條件下，硫化物才能*的轉化為單質硫而無SO₄^2-產生，所以，在采用綠色硫細菌脫硫過程中必須嚴格控制反應條件^[8]。

　　3沼氣生物脫硫原理

　　化能自養型微生物以CO₂為碳源，同時在氧化S^2-的過程中獲得能量。在有機碳源存在的情況下，部分種類的自養微生物可以利用有機體碳源進行異養代謝。化能自養型微生物將S^2-轉化為單質硫，既可以在有氧的條件下進行，也可以在無氧的條件下進行。在有氧的情況下氧作為電子受體，而在無氧的情況下可以利用硝化物作為電子受體^[9，10]。很多化能自養型微生物都能以單質硫、H₂S、硫代硫酸鹽以及有機硫化物為電子供體，其中具有代表性的微生物是氧化亞鐵硫桿菌、脫氮硫桿菌、排硫硫桿菌、氧化硫硫桿菌。化能自養型微生物將S^2-轉化為單質硫的過程如下：

　　當氧為生化反應的限速因素時，單質硫為主要產物;當S^2-為生化反應的限速因素時，主要產物是SO₄^2-而不是單質硫。