一、mRNA的分離 
與rRNA和tRNA不同的是，哺乳動物細胞的絕大部分mRNA在其3’端均有一poly(A)尾，因此可以用oligo(dT)－纖維素親和層析法從大量的細胞RNA中分離mRNA。在構建cdna文庫時， 必須經上述純化步驟制備mRNA模板。進行Northern雜交或Sl 核酸酶作用圖分析時，與總RNA相比，采用poly(A)+ RNA能獲得更為滿意的結果。 可以按照Gilham(1964)所述方法制備Oligo(dT)－纖維素，也可以買現成的產品。 
1）用0.1mol/L NaOH懸浮0.5-1.0g 0ligo(dT)－纖維素。 
2）將懸浮液裝入滅菌的一次性層析柱或裝入填有經用DEPC處理并經高壓滅菌的玻璃棉的巴期德吸管中， 柱床體積為0.5-1.0ml，用3倍柱床體積滅菌水沖洗柱床。柱床體積為1m的oligo(dT)－纖維素zui大量為10mg總RNA，如果總RNA的量較少，則應減少oligo(dT)－纖維素的使用量以防止poly(A)+RNA在過柱以及后續步驟中損失。 
3）用無菌的1x層析柱加樣緩沖液沖洗柱床直至流出液的pH值小于8.0。1x層析柱加樣緩沖液 
20mmol/L Tris.Cl(pH7.6) 
0.5mol/L NaCl 
1mmol/L EDTA(pH8.0) 
0.1％SDS 
可按以下方法制備滅菌的層析柱加樣緩沖液；將適量無rna酶的Tris. Cl(pH7.6)、氯化鈉和EDTA貯存液混合在15lbf/in2(1.034x105Pa)高壓下蒸氣滅菌，待其次序卻至65℃左右時加入已在65℃預熱30分鐘的10 ％SDS貯存液。也可以用0.05mol/L檸檬酸鈉代替Tris.Cl 然后用DEPC處理檸檬鈉－NaCL-EDTA和SDS的混合溶液。 
4）用滅菌水溶解RNA，于65℃溫育5分鐘后使迅速冷卻至室溫，加等體積的2x層析柱加樣緩沖液，上樣，立即用滅菌的試管收集洗液。 當所的RNA溶液均進入柱床后，加1倍體積的1x層析柱加樣 ，繼續收集洗出液。加熱RNA可以破壞可能涉及poly(A)尾的二級結構。 
5）當全部溶液流出后，將收集液置于65℃溫育5分鐘，重新上樣，并收集流出液。 
6）用5-10倍柱床體積的1x層析柱加樣緩沖液洗柱，分部收集洗出液，測定每一收集管的OD260。zui補由于不帶poly)A)的RNA洗過柱床， OD260會很高，后來OD260值則很小或為零。在某些方案中，上述步驟后還用5倍柱術體積的含0.1mol/L NaCl的1x 層析柱加樣緩沖液洗柱床，然而由于洗出的不帶poly(A)的RNA很少甚至沒有， 因此這一步驟可以省略。 
7）用2－3倍柱床體積的經滅菌且無RNA酶的洗脫緩沖液洗脫mRNA，以1/3－1/2柱床體積分部收集洗脫液。洗脫緩沖液 
10mmol/L Tris.Cl(pH7.6) 
1mmol/L EDTA(pH8.0) 
0.05％SDS