概念編輯
mRNA:即messenger RNA 信使RNA是由DNA經由轉錄而來,帶著相應的遺傳訊息,為下一步轉譯成蛋白質提供所需的訊息。在細胞中,mRNA從合成到被降解,經過了數個步驟。在轉錄的過程中,第二型RNA聚合酶從DNA中復制出一段遺傳訊息到mRNA前體pre-mRNA上。在原核生物中,除了5'加帽之外mRNA并未被進一步處理而經常是邊轉錄邊轉譯。在真核生物中,轉錄跟轉譯發生在細胞的不同位置,轉錄發生在儲存DNA的細胞核中,而轉譯是發生在細胞質中。
轉錄組學(transcriptomics)是在基因組學后新興的一門學科,即研究特定細胞在某一功能狀態下所能轉錄出來的所有RNA(包括mRNA和非編碼RNA)的類型與拷貝數。Illumina提供的mRNA測序技術可在整個mRNA領域進行各種相關研究和新的發現。mRNA測序不對引物或探針進行設計,可自由提供關于轉錄的客觀和信息。研究人員僅需要一次試驗即可快速生成完整的poly-A尾的RNA完整序列信息,并分析基因表達、cSNP、全新的轉錄、全新異構體、剪接位點、等位基因特異性表達和罕見轉錄等全面的轉錄組信息。簡單的樣品制備和數據分析軟件支持在所有物種中的mRNA測序研究。 [1]
測序流程編輯
1)樣本準備(3days)
圖1所示。 [2]
2)上機測序1X40(single run,50h),2X80(PE,180h),2X100(PE,220h),2X120(PE,260h),2X150(PE,320h)
3)圖像識別,Basecalling,過濾接頭序列,檢測可能的樣品污染。
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