主要特征編輯
(1)circRNA由特殊的可變剪切產(chǎn)生,大量存在于真核細胞的細胞質中,但少部分內含子來源的circRNA則存在于細胞核內,具有一定的組織、時序和疾病特異性;
(2)廣泛存在于人體細胞中,有時甚至超過它們線性異構體的10倍之多;
(3)與傳統(tǒng)的線型RNA(linear RNA,含5'和3'末端)不同,circRNA分子呈封閉環(huán)狀結構,不易被核酸外切酶RNaseR降解,比線性RNA更穩(wěn)定;
(4)具有高度保守性,部分具有快速的進化性改變;
(5)大多數(shù)來源于外顯子,少部分由內含子直接環(huán)化形成;
(6)部分circRNA分子含miRNA應答元件(miRNAresponse element,MRE),可充當競爭性內源RNA(competing endogenousRNA,ceRNA),與miRNA結合,在細胞中起到miRNA海綿的作用,進而解除miRNA對其靶基因的抑制作用,上調靶基因的表達水平;
(7)可以翻譯成蛋白質,但大部分是非編碼RNA。
形成機制編輯
circRNA通過非經(jīng)典剪接方式進行反向剪接形成。一種模型認為pre-RNA 的轉錄過程中由于RNA發(fā)生了部分折疊,拉近了原本非相鄰的外顯子,從而發(fā)生了外顯子跳躍( exon skipping ) ,使得被跨越的區(qū)域形成了環(huán)形RNA中間體,進一步通過套索剪接形成由外顯子構成的環(huán)形RNA分子。另一種模型認為,位于內含子區(qū)域的反向互補序列導致了內含子區(qū)域配對介導反向剪接從而形成環(huán)形RNA分子。
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